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不一定的，若是取得自产自销的免税农产品普通发票可以抵扣增值税，但是若是取得的属于批发零售的免税农产品普通发票不可以抵扣增值税。
注意防范抵扣风险
1、财务人员切记不要片面的认为一般纳税人只要取得免税农产品的发票，就可以抵扣9%的增值税！这样理解是错误的。
2、我们拿到一张免税农产品普通发票，首先可以看看对方单位名称，一般来讲名称为某某农业公司、某某农民专业合作社、某某家庭农场、某某养殖场等，大部分属于自产自销的，当然还可以要求对方提供一定的自产自销证明比如种植基地的土地租赁协议等，来证明对方属于自产自销。
3、比如若是从自产自销的合作社购买的鸡蛋，取得的发票税率栏是免税字样，则超市可以抵扣9%的增值税。若是从批发零售的单位购买的鸡蛋，取得的发票税率栏是免税字样，则超市不可以抵扣9%的增值税。
4、因此有的时候取得了免税农产品发票，但是也不得抵扣增值税，比如批发和零售的种子、种苗、化肥、农药、农机免征增值税，取得了这样的免税发票不得抵扣。
5、再比如今年小规模纳税人免征增值税，因此取得了批发零售小规模公司的销售农产品发票，虽然是免税发票，但是也不得抵扣。
6、以前有税务局要求提供免税备案表，但是国家税务总局关于进一步优化增值税优惠政策办理程序及服务有关事项的公告》（国家税务总局公告2021年第4号），自4月1日开始，免征增值税不再要求备案。
7、总之目前对于自产自销的辨别，税务上没有统一和明确的规定，各地自己掌握业务的真实性。
8、为了防范和降低抵扣风险及损失，建议采购农产品的时候，对于难以区分是否属于自产自销的，可以在采购合同中约定一旦取得的发票不属于自产自销，所造成的抵扣损失由销售方承担。
